Sangerarea - este cea mai frecventa si periculoasa complicatie a trombolizei sistemice. Incidenta hemoragiei majore (ce necesita intreruperea terapiei si/sau transfuzie sanguina), este intre 7- 45%. Numarul si tipul de proceduri invazive precum si durata terapiei influenteaza semnificativ incidenta hemoragiilor, astfel incat evitarea procedurilor ce nu sunt necesare cu pastrarea unui sistem vascular intact, este cea mai buna masura de prevenire. Hemoragia interna, evidentiata printr-o scadere inexplicabila a hema-tocritului, este de obicei rezultatul unei selectii superficiale a pacientilor, sau a necunoasterii factorilor de risc. Poate sa apara si hemoragia in spatiul intracranian care este foarte periculoasa. Ca o regula, orice modificare in statusul neurologic al unui bolnav sub tratament trombolitic, va fi considerat a fi aceasta complicatie, pana la proba contrara. Se va opri administrarea liticului, se va administra crioprecipitat sau plasma congelata. Nu se recomanda administrarea de acid epsilon-aminocaproic, deoarece poate agrava procesul litic. Hemoragia superficiala poate fi controlata prin masuri locale. Deoarece sangerarea tinde sa apara in perioada dintre terminarea administrarii liticului si inceputul tratamentului cu heparina, este bine sa se intarzie administrarea anticoagulantului pana cand timpul de trombina este mai mic decat dublul timpului normal, si se va incepe fara doze de incarcare.
Embolia pulmonara - poate sa apara in timpul tratamentului pentru tromboza venoasa profunda. Incidenta pare a fi similara terapiei cu heparina. in absenta complicatiei hemoragice, este recomandata continuarea terapiei litice. Oricum, daca apar embolii recurente, intreruperea tratamentului cu agent fibrinolitic, administrarea de heparina, si insertia unui filtru pe cava poate salva viata bolnalui.
Reactii alergice majore - sunt foarte rare cu SK, si nu constituie o problema cu UK. in 30% din cazuri poate sa apara reactii febrile alergice la pacientii ce primesc SK, si in 3% din pacientii ce primesc UK. Daca se constata reactii majore, se recomanda intreruperea terapiei litice.